Ранние, проприетарные
CTSS (The Compatible TimeShare System, разработанная в MIT — Массачусетском технологическом институте).
Incompatible Timesharing System (The Incompatible Timeshare System, разработанная в MIT для серверов DEC 10 / 20).
THE (разработана Эдсгером Дейкстрой и другими).
MULTICS (проект Bell Labs, GE, и MIT).
Master programme разработанная LEO computer, Leo III в 1962 году.
Business Operating System (BOS) — кросс-платформенная, основанная на командной строке.
Commodore PET, Commodore 64, и Commodore VIC-20.
Sinclair Micro и QX, и подобные.
TRS-DOS, ROM OS (улучшенный интерпретатор Microsoft BASIC с поддержкой файловой системы).
TI99-4.
FLEX от Technical Systems Consultants для микрокомпьютеров, построенных на Motorola 6800 и 6809: SWTPC, Tano, Smoke Signal Broadcasting, Gimix и других.
HDOS — Heath DOS, для микрокомпьютеров.
Cray Operating System для суперкомпьютеров Cray Research.
Проприетарные
Acorn
Arthur
ARX
MOS (на BBC Micro и BBC Master)
RISC OS
RISCiX
Atari ST
TOS
MultiTOS
MiNT
Apple
A/UX
Apple Darwin
Apple DOS
GS/OS
Mac OS
Mac OS 8
Mac OS 9
Mac OS X
  10.0 Cheetah
  10.1 Puma
  10.2 Jaguar
  10.3 Panther
  10.4 Tiger
  10.5 Leopard
  10.6 Snow Leopard
ProDOS
SOS
Корпорация Be
BeOS
BeIA
Zeta
Control Data Corporation
CDC KRONOS
CDC NOS
CDC SCOPE
DEC/Compaq/HP
AIS
OS-8
ITS (для PDP-6 и PDP-10)
TOPS-10 (для PDP-10)
TOPS-20 (для PDP-10)
WAITS
TENEX (от BBN)
RSTS/E (работала на нескольких типах машин, в основном PDP-11)
RSX-11 (многопользовательская многозадачная ОС для PDP-11)
RT-11 (однопользовательская для PDP-11)
RTE-II (система реального времени для HP-2000/2100 и ДОС РВ для М-6000/7000, СМ-1)
VMS (от DEC для серии компьютеров VAX, позднее переименована в OpenVMS)
HP-UX от HP
NonStop OS — разработана компанией Tandem Computers, впоследствии приобретённой фирмой Compaq
OSF/1 (от DEC; дважды переименована, сначала в Digital UNIX, затем в Tru64 UNIX)
IBM
IBSYS
OS/2
OS/2 v1.0 — Выпущена в декабре 1987 года. Одна из первых операционных систем с поддержкой многозадачного режима процессора 80286.
OS/2 v1.10SE — Выпущена в октябре 1988 года. SE = Standard Edition.
OS/2 v1.10EE — 1989 год.
OS/2 v1.20 — 1989 год. Редакции SE и EE. Улучшенный Presentation Manager.
OS/2 v1.30 — 1991 год. Также редакции SE и EE.
OS/2 v2.00 — Весна 1992 года. Первая версия OS/2, которой для работы необходим процессор 80386 с его защищённым режимом.
OS/2 v2.10 — Май 1993 года.
OS/2 v2.11 — Конец 1993 года. Не содержит подсистемы Win-OS/2 и устанавливается поверх Windows 3.1. Стоит дешевле других версий OS/2.
OS/2 v3.0 «Warp» и «Warp Connect» — Октябрь 1994 года.
OS/2 v4.0 «Merlin» — Сентябрь 1996 года.
OS/2 Warp 4.5 Server for E-business «Aurora» — Апрель 1999 года. Дальнейшие обновления получили имена CP1 и CP2 (Convenience Package) и базировались на Aurora.
eComStation
AIX — Unix-подобная ОС
AIX/RT
AIX/6000
AIX PC
AIX/ESA
AIX/370
AIX 5L
DYNIX — Unix-подобная ОС, разработана компанией Sequent Computer Systems, которая позже была поглощена IBM
OS/400
VM
DOS/360
DOS/VSE
OS/360 — первая ОС для архитектуры System 360
MFT — позднее переименована в OS/VS1
MVT — позднее переименована в OS/VS2
SVS
MVS — разновидность MVT
TPF
ALCS
OS/390
z/OS — следующая версия после IBM OS/390
z/VM — разновидность VM
z/VSE — разновидность VSE
Basic Operating System — первая ОС для архитектуры System 360
PC DOS — OEM-версия MS-DOS, впоследствии дорабатывалась самостоятельно.
ОС ЕС, СВМ, МВС, ДОС ЕС, МОС ЕС — IBM-совместимые операционые системы (клоны) советского производства
ICT/ICL
GEORGE
VME
DME
TME
Microsoft
MSX-DOS
MS-DOS (разные моды)
Xenix — лицензированная версия Unix; продана SCO в 1990-х
Microsoft Windows
Windows 1.0
Windows 2.0 (для 80286)
Windows 3.0 — первая версия, имевшая коммерческий успех
Windows 3.1
Windows for Workgroups 3.11
Windows 9x — версии Windows 4.x, новое семейство, сохранявшее преемственность с Windows 3.x
Windows 95 (версия Windows 4.00.950)
Windows 98 (версия Windows 4.10.1998)
Windows Me (версия Windows 4.90.3000)
Windows NT — ОС, разрабатываемая в Майкрософт с 1988 года командой во главе с Дэвидом Катлером под рабочим названием OS/2 Version 3.
Windows NT 3.1 — первая версия Windows NT, выпущена 27 июля 1993
Windows NT 3.5 (варианты поставки: Workstation — для рабочих станций и Server — для серверов)
Windows NT 3.51 — отлаженная версия Windows NT 3.5
Windows NT 4.0 (варианты поставки: Workstation — для рабочих станций и Server — для серверов)
Windows 2000 (версия Windows NT 5.0)
Windows XP (версия Windows NT 5.1 — внутренне основана на ядре Windows 2000); варианты поставки: Home, Professional, Tablet PC Edition, Media Center Edition, Embedded
Windows Server 2003 (версия Windows NT 5.2) — вариант Windows XP для работы на серверах
Windows Compute Cluster Server 2003 — вариант Windows XP для работы в кластерных системах
Windows XP Embedded — вариант Windows XP для встраиваемых систем
Windows Vista (версия Windows NT 6.0)
Windows Server 2008 (версия Windows NT 6.0) — вариант Windows Vista для работы на серверах
Windows HPC Server 2008 — замена Windows Compute Cluster Server 2003 для кластерных систем
Windows Home Server
Windows Vista for Embedded Systems — вариант Windows Vista для встраиваемых систем
Windows 7 (версия Windows NT 6.1)
Windows Server 2008 R2 (версия Windows NT 6.1) — вариант Windows 7 для работы на серверах
Windows CE (compact edition — компактная редакция) — Операционная система реального времени для встраиваемых систем, мобильных телефонов, наладонных компьютеров и даже роботов.
Windows Mobile, Pocket PC — версии Windows CE для мобильных телефонов и наладонных компьютеров.
Windows Embedded — версии Windows CE для встраиваемых систем, включая роботов.
Novell
NetWare — сетевая ОС
NetWare 3.x, в том числе Netware v3.12
NetWare 4.x
NetWare 5.x
NetWare 6.x
Novell DOS — клон MS-DOS
UnixWare — разработана на основе UNIX System V, в 1995 году Novell продала права на дальнейшую разработку компании Santa Cruz Operation.
openSUSE — дистрибутив свободной операционной системы GNU/Linux, разработчиком которого является корпорация Novell, Inc.
Open Enterprise Server — сетевая ОС, включает в себя Novell NetWare, openSUSE и набор сетевых служб.
Strawberry Development Group.
EROS
CapROS
Sun Microsystems
SunOS — Unix-подобная ОС, основана на реализации BSD Unix
SunOS 4.x — (Solaris 1.x)
Solaris — Unix-подобная ОС, основана на реализации UNIX System V Release 4 + наработки из SunOS
SunOS 5.x — (Solaris 2.x, 7.x и более поздние)
Java Desktop System
Другие проприетарные Unix-подобные и POSIX-совместимые ОС
Aegis/OS (Apollo Computer)
CLIX от Intergraph
Cromix (Unix-emulating OS from Cromemco)
Coherent (Эмулирующая Unix ОС от Mark Williams Co. для персональных компьютеров)
DNIX
DYNIX — Unix-подобная ОС, разработана компанией Sequent Computer Systems, которая позже была поглощена IBM
Idris
IRIX от SGI
NeXTStep — свое развитие получила в ОС Mac OS X после объединения компаний NeXT и Apple
OPENSTEP
OS-9 — Unix-подобная RTOS, эмулирующая Unix от Microware для процессора Motorola 6809
OS-9/68k (Эмулирующая Unix от Microware для процессора Motorola 680x0; создана из OS-9)
OS-9000 (портативная эмуляция Unix от Microware; одна из реализаций предназначена для Intel x86)
QNX (POSIX, микроядерная операционная система; используется, в основном, во встроенных системах реального времени)
Rhapsody
RiscOS
SCO UNIX (от Santa Cruz Operation, куплена компанией Caldera, позже переименованной в SCO)
System V (реализация AT&T Unix, 'SVr4' 4й релиз). Фактически последний «чистый» UNIX. Всё остальное обычно называют UNIX подобным…
UNIflex (Эмулирующая Unix ОС от TSC для DMA-совместимых, Motorola 6809 с расширенной адресацией; например, SWTPC, GIMIX, …)
Ultrix (первая версия Unix для VAX и PDP-11 от DEC, основана на BSD)
Unicos (Unix для суперкомпьютеров Cray Research Inc.)
Venix
Свободные
Unix-подобные
BSD (Berkeley Software Distribution, реализация Unix для DEC VAX) и её вариации:
386BSD
DesktopBSD
DragonFly BSD
FreeBSD
MidnightBSD
NetBSD
OpenBSD — основной акцент на безопасности
PC-BSD
TrianceOS
TrueBSD
GNU/Hurd (ОС, реализованная как набор серверов работающих на микроядре Mach)
Hurd/L4 (ОС, реализованная как набор серверов работающих на микроядре L4)
GNU/Linux
Linux (наиболее популярное свободное Unix-подобное ядро)
Cosmoe (основана на ядре «Linux» и использует много кода AtheOS, подобна BeOS)
OpenSolaris (проект по открытию кодов Solaris)
AuroraUX
BeleniX
Jaris
MilaX
marTux
Nexenta OS
NexentaStor
OpenSolaris for System z
OSUNIX
Polaris
SchilliX
StormOS
Plan 9 (распределённая ОС, разработана Bell Labs)
Plan B (распределённая ОС, произошедшая от Plan 9)
Off++ (распределённая ОС, произошедшая от Plan 9)
Inferno (ОС на основе виртуальной машины, произошла от Plan 9)
SSS-PC (разработана в Токийском Университете)
Windows-совместимая операционная система
ReactOS
Исследовательские Unix-подобные
UNIX (разработана Bell Labs в 1970 году, идея Кена Томпсона)
Mach (от разработчиков ядер ОС в CMU; см.: NeXTSTEP)
Minix (учебная ОС от Эндрю Таненбаума)
Amoeba (разработана Эндрю Таненбаумом)
K42 (разрабатывается в IBM)
MISS (первая отечественная UNIX-подобная операционная система)
ДЕМОС (советский клон UNIX)
ИНМОС (Инструментальная мобильная операционная система — разработана в СССР в 1985 году в ИНЭУМ Институт электронных управляющих машин, Головное КБ Минприбора).
Исследовательские не-UNIX
3OS — Object Oriented Operation System (подробности)
Nemesis исследовательская ОС от Кембриджского Университета — подробности (на английском)
TUNES, 1994
V (operating system) Stanford, ранние 1980-е
Microsoft Singularity
Клоны MS-DOS
QDOS (разработана Seattle Computer Products для новых процессоров Intel 808x; также известна как SCP-DOS; лицензирована Microsoft, стала MS-DOS/PC-DOS)
MS-DOS (разработана Microsoft для IBM PC-совместимых машин)
PC-DOS (версия DOS от IBM для PC)
DR-DOS (MS-DOS-совместимая ОС от Digital Research, потом Novell, Caldera, Siemens AG …; в настоящее время используется в специфических задачах)
FreeDOS (свободная DOS, цель — 100 % совместимость с MS-DOS)
PTS-DOS (MS-DOS-совместимая ОС от PhysTechSoft (Россия))
ROM-DOS (MS-DOS-совместимая ОС от Datalight для встроенных систем)
АДОС (советский клон MS-DOS для ПК Искра-1030)
Альфа-ДОС (советский клон MS-DOS для ПК ЕС-1840)
ЯНУС (советский клон MS-DOS для ПК ЕС-1840)
Авторские/внутренние, не-UNIX, и другие
A2 — новое название для Bluebottle (см. также AOS)
AOS — ОС созданная в рамках проекта «Oberon — операционная система и компилятор» (Оберон (операционная система))
AROS (AROS Research Operating System), свободная портируемая (в том числе, для процессорной линейки x86) операционная система, идейный потомок AmigaOS
AtheOS
Bluebottle развитие идей AOS, современное название A2 (см. также AOS)
CP/M (Control Program/Monitor)
CP/M-80 (CP/M для Intel 8080/8085 и Zilog Z80 от Digital Research))
CP/M-86 (CP/M для Intel 8088/86 от Digital Research)
MP/M-80 (многопрограммная версия CP/M-80 от Digital Research)
MP/M-86 (многопрограммная версия CP/M-86 от Digital Research)
МикроДОС (создана в СССР на основе CP/M 2.2)
UCSD P-System (портативная среда программирования/операционная система/виртуальная машина, разработана студентами университетов Калифорнии в Сан-Диего; управляется профессором Ken Bowles, написана на языке Паскаль)
FLEX9 (от TSC для Motorola 6809, наследница FLEX, работавшей на Motorola 6800)
JavaOS (основным компонентом является Java VM)
SSB-DOS (от TSC для Smoke Signal Broadcasting, разновидность FLEX)
DESQView многозадачная надстройка над MS-DOS для запуска MS-DOS приложений в режиме вытесняющей многозадачности с API кооперативной многозадачности, 1985 год. Текстовый интерфейс. Последняя версия 2.70.
DV/X Развитие DESQView, заимствовавшее интерфейс и протокол X Window System.
GEOS
NewOS open source
Оберон (операционная система), разработана ETH-Zurich (Никлаусом Виртом и другими) для рабочих станций Ceres и Chameleon. См. также Оберон (язык программирования).
osFree (open source вариант OS/2)
TripOS, 1978
VisiOn (первый графический пользовательский интерфейс для PC, коммерческого успеха не имел.)
VME от International Computers Limited (ICL)
MorphOS (на микроядре Quark, с поддержкой API AmigaOS 3.1)
NetWare (от Novell)
Pick (лицензирована и переименована)
Primos от Prime Computer (иногда пишется PR1MOS или PR1ME)
OSD/XC от Fujitsu-Siemens (BS2000 портирована для эмуляции на Sun платформы SPARC)
OS-IV от Fujitsu (базируется на ранней MVS от IBM)
MSP от Fujitsu (наследник OS-IV)
SkyOS (коммерческая ОС для PC)
Syllable (развивается на базе AtheOS)
Haiku-OS свободный клон BeOS
TinyOS
TSX-32 многозадачная 32-битная операционная система для DOS приложений, частично заимствовавшая идеи OS/2, DESQView и операционных систем фирмы DEC. ~1993 год. Отличалась самой быстрой реализацией файловой системы FAT16 из известных.
Siemens AG
BS1000
BS2000
BS3000 (функционально похожа на OS-IV и MSP от Fujitsu)
VM2000
SINIX — Unix-подобная ОС, ранее называлась Reliant UNIX, разработана на основе DC/OSx
DC/OSx — DataCenter/OSx, доставшаяся Siemens AG после поглощения компании Pyramid Technology
«Домашние» OS
KolibriOS (проект основан на MenuetOS и помещается на одну дискету) - #-сам пробовал! - неплохая системка с исходниками, я б сказал - база для самостоятельной разработки систем!-#
LainOS (проект основан на FreeBSD. Навеян GUI «Navi» из «Serial Experiments Lain»)
MenuetOS (помещается на одну дискету)
Miraculix
Panalix
Syllable (почти полностью совместима с POSIX)
Trion Operating System
Висопсис (VISOPSYS — Визуальная операционная система)
UzhOS
XSKernel (проект ядра операционной системы под кодовым названием XSystem)
FOS (микроядерная операционная система)
ExeOS (проект операционной системы, основанной на микроядерной архетикутре)
SymbOS (многозадачная графическая ОС для Amstrad CPC, Amstrad PCW и MSX)
Операционные системы для БК
Операционные системы, работавшие на БК-0010, БК-0010-01, БК-0011 и БК-0011М
ANDOS
MK-DOS
CSI-DOS
NORD
ОС БК-11 (вариант RT-11)
AO-DOS
BASIS
DOSB10
PascalDOS
MicroDOS
DX-DOS
HC-DOS
RT-11 (во внешнем ПЗУ)
NORTON-БК
РАМОН
KMON
Turbo-DOS
BKUNIX
Операционные системы для Spectrum
+3DOS
C-DOS
CP/M
Doors
IS-DOS
PinkFloyd
TASiS
TR-DOS
Прикладные системы
Наладонный компьютер (PDA)
Palm OS от Palm Inc; теперь подразделения PalmSource
Pocket PC, Windows Mobile от Microsoft
EPOC изначально от Psion (Великобритания), в настоящее время разрабатывается Symbian, под маркой Symbian OS
Windows CE от Microsoft
GNU/Linux в Sharp Zaurus
Смартфоны
Windows Mobile на базе Windows CE
GNU/Linux
Google Android в HTC T-Mobile G1;
Palm webOS в Palm Pre;
Maemo в Nokia 770 Internet Tablet, Nokia N800, N810 и Nokia N900;
OpenMoko в устройствах Neo 1973 и Neo FreeRunner;
MontaVista Mobilinux в Motorola A760, E680;
EZX Linux в Motorola A1200, A1600, E6;
MOTOMAGX в Motorola ZINE ZN5;
Access Linux Platform в Edelweiss.
Symbian OS
IPhone OS — ОС для Apple iPhone
BlackBerry OS
JavaFX Mobile
Нетбуки, Смартбуки, MID
EPOC32 Release 5 в Psion netBook 1999 года;
Microsoft Windows CE в Psion Teklogix netBook Pro 2003 года, в Elonex Smartbook и др.
Microsoft Windows CE MID в Toshiba JournE;
GNU/Linux
Xandros Linux;
Xubuntu;
Eeebuntu;
Linpus Linux Lite в Acer Aspire One;
Google Android в Acer Aspire One;
Ubuntu Netbook Remix;
Moblin for Netbooks;
Google Chrome OS (проектируется).
Маршрутизаторы
CatOS от Cisco
IOS от Cisco
IOS XR от Cisco на основе QNX
JUNOS от Juniper Networks
LinkBuilder от 3Com
MikroTik RouterOS от MikroTik
PIX OS от Cisco
RapidOS от Riverstone Networks
МиниАТС
Orix от Avaya
ОС для микроконтроллеров, встраиваемые ОС, ОС реального времени
Contiki
eCos
FreeRTOS
INTEGRITY
ITRON
LynxOS
Montavista Linux
Nucleus
QNX
OS-9 от Microware
OS-9000 от Microware
OSA  — для микроконтроллеров PIC фирмы Microchip
OSE от ENEA
OSEK
RDOS
RTEMS первоначальная разработка велась по заказу МО США, сейчас opensource (GPL-like лицензия)
RTOS
ThreadX
TRON OS разработчик — Ken Sakamura
uC/OS-II для микроконтроллеров
scmRTOS для микроконтроллеров
μClinux
VxWorks
Salvo для микроконтроллеров

Литература
Вильям Столлингс. Operating Systems: Internals and Design Principles. http://www.williamstallings.com/

вики http://ru.wikipedia.org/

разные материалы с гугла.